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    項(xiàng)目介紹


    宏基因組學(xué)(Metagenomics)研究通過全基因組鳥槍法(Whole  Genome Shotgun，WGS)測序策略，將提取獲得的微生物組總DNA隨機(jī)打斷為短片段，并構(gòu)建合適長度的插入片段文庫，對這些文庫進(jìn)行雙端(Paired-end，PE)高通量測序，從而能精細(xì)地展示整個菌群的功能代謝譜和物種精細(xì)組成譜，進(jìn)而在組成和功能水平分別挖掘關(guān)鍵生物標(biāo)記物，從原理上闡明微生物群落在生態(tài)系統(tǒng)中發(fā)揮作用的根本機(jī)制。

    技術(shù)路線：

    樣品要求

    1.DNA：DNA濃度>20ng/ul，體積大于20ul；并確保DNA無降解，無污染；

    2.環(huán)境樣本：土壤5-10 g，污泥/沉積物5-10 g，水體-濾膜過濾至有可見覆蓋物，糞便3-5 g，血液10 mL；

    3.樣本處理時，需避免污染，保存期間切忌反復(fù)凍融，且需要干冰寄送的樣本，請?zhí)崆白孕袦?zhǔn)備干冰。

    項(xiàng)目案例

    基于GraPhlAn的樣本總體分類等級樹圖

    種水平的優(yōu)勢微生物關(guān)聯(lián)網(wǎng)絡(luò)圖

    Top50差異物種的聚類熱圖

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